Johan blev gift med Ida Chatrine Mørch 11 maj 1836. Ida (datter af Chresten Lange Mørch og Maren Wilhelmsdatter Brochmann) blev født 1807 i Ferslev Præstegård, Ferslev sogn, Fleskum herred, Ålborg amt; blev døbt 10 sep. 1807 i Hjemmedøbt; døde 7 apr. 1908 i Nyborg Landsogn, Dyrehavevejen, Avnslev, Vindinge herred, Svendborg amt; blev begravet 13 apr. 1908 i Gravlagt på Assistenskirkegården i Nyborg. [Gruppeskema]

1. John Christian Emil Clemensen blev født 1 mar. 1837 i Ålborg, Nørregade, Vor Frue sogn, Fleskum herred, Ålborg amt; blev døbt 14 maj 1837 i Ålborg, Vor Frue kirke og sogn, Fleskum herred, Ålborg amt; døde 30 dec. 1918.
2. Catharine Marie Wilhelmine Clemensen blev født 22 nov. 1838 i Ålborg, Budolfi sogn, Fleskum herred, Ålborg amt; blev døbt 3 maj 1839 i Ålborg, Budolfi kirke og sogn, Fleskum herred, Ålborg amt; døde 1 dec. 1839 i Ålborg, Adelgaden, Budolfi sogn, Fleskum herred, Ålborg amt; blev begravet 11 dec. 1839 i Ålborg, Budolfi kirkegård og sogn, Fleskum herred, Ålborg amt.
3. Jens Frederik Andreas Clemensen blev født 5 okt. 1840 i Ålborg, Budolfi sogn, Fleskum herred, Ålborg amt; blev døbt 16 okt. 1840 i Hjemmedøbt; døde 21 jan. 1841 i Ålborg, Budolfi sogn, Fleskum herred, Ålborg amt; blev begravet 26 jan. 1841 i Ålborg, Budolfi kirkegård og sogn, Fleskum herred, Ålborg amt.
4. Louis Frederik Clemensen blev født 13 feb. 1842 i Ålborg, Budolfi sogn, Fleskum herred, Ålborg amt; blev døbt 15 apr. 1842 i Ålborg, Budolfi kirke og sogn, Fleskum herred, Ålborg amt; døde 15 jul. 1890 i Århus Amtssygehus; blev begravet 21 jul. 1890 i Hjortshøj kirkegård og sogn, Øster Lisbjerg herred, Randers amt.
5. Amalia Clemensen blev født 15 aug. 1845 i Nyborg sogn, Vindinge herred, Svendborg amt ; blev døbt 5 sep. 1845 i Nyborg kirke og sogn, Vindinge herred, Svendborg amt ; døde Ja.